小南与长门最后都没能活到和平到来的那一天，但两人的结局并不相同：长门在木叶之战后施展轮回天生之术，复活被佩恩杀死的木叶忍者，随后耗尽生命而死；小南则回到雨隐村，继续守护他们曾经寄托希望的道路，后来为保护长门的轮回眼与带土交战，最终战死。
长门的结局：以生命换回木叶死者
长门、小南和弥彦原本是雨之国的同伴，一起追求不再让普通人承受战争痛苦的未来。弥彦死后，长门受到打击，逐渐把“让世界感受痛苦”当作实现和平的手段。他以佩恩六道的身份行动，袭击木叶，也因此与鸣人正面相遇。
鸣人没有接受长门用恐惧维持和平的想法，却也没有只把他当作必须打倒的敌人。鸣人谈起自来也留下的信念，告诉长门自己仍愿意寻找结束仇恨的方法。长门从两人的对话中重新想起弥彦和自来也，也意识到自己曾经追寻的愿望并未完全消失。
最终，长门选择用轮回天生之术复活木叶村中被佩恩杀死的人。这个忍术耗费了他所剩无几的生命，施术后长门便死去。他把继续追求和平的责任托付给鸣人，相信鸣人能够走出不同于自己的道路。对长门而言，这既是对木叶伤亡的补偿，也是他重新选择相信他人的最后行动。
所以，长门并不是在与鸣人的战斗中被鸣人杀死，也没有在施术后恢复健康。他是主动牺牲自己，让被佩恩夺去生命的人回来。小南随后带走长门和弥彦的遗体，回到雨隐村安葬旧日同伴。
小南的结局：为守护长门遗体与希望而战
长门死后，小南离开晓组织，回到雨隐村。她不再追随以战争和痛苦支配世界的做法，而是把鸣人视为值得信任的人，愿意支持他继续寻找和平。她守着长门与弥彦的遗体，也不愿让带土夺走长门的轮回眼。
带土来到雨隐村索要轮回眼时，小南没有退让。她利用纸遁展开攻势，把周围环境化作层层纸片与起爆符，并针对带土借助神威虚化的能力布置陷阱。她准备的大规模爆炸持续时间超过带土通常维持虚化的极限，一度将他逼入绝境。
然而，带土用伊邪那岐改变了自己被炸死的结果，躲过小南的致命攻击。随后他制服并杀死小南，逼问出长门遗体的所在，最终取得轮回眼。小南的战斗没有守住长门的眼睛，也没能改变自己的死亡结局，但她直到最后都没有背弃对鸣人和昔日同伴的信任。
两人的结局有什么联系
长门把希望交给鸣人后死去，小南则在长门死后继续守护这份希望，直到与带土战斗时牺牲。两人没有在结尾一同生还，也没有在雨隐村迎来和平后的重逢；他们的故事是先后落幕，留下的信念由鸣人继续承接。
两人的选择也形成了鲜明对照：长门曾经用痛苦逼迫世界理解战争，最后却用自己的生命拯救他人；小南曾陪伴长门走过偏离初心的道路，最后选择相信鸣人能找到新的答案。长门以轮回天生之术挽回木叶死者，小南则以生命抵抗带土，试图保护他们交给未来的希望。
概括来说，长门在复活木叶死者后牺牲，小南在雨隐村与带土交战时战死。两人最终都没有亲眼见证和平实现，但他们留下的信念推动鸣人继续走下去。